为了响应党中央和政府的号召，发挥民间公益组织的力量，配合政府，共同支援灾区，南都公益基金会决定紧急安排1000万元专款，用于资助民间公益组织利用其自身的专业技能开展救灾和灾后重建的公益服务项目。这是汶川地震发生以来非公募基金会提供的数额最大的一笔捐款。
    汶川地震发生后，南都公益基金会迅速作出反应，5月13日，南都公益基金会迅速联络一批知名公益组织，发起了“抗震救灾，十万火急  灾后重建，众志成城——中国民间组织抗震救灾行动联合声明”活动。活动得到了广大民间组织的积极支持，截至目前，已有120多家民间组织响应（http://www.nandufoundation.org/zhenzai.asp）。
    中国民间组织抗震救灾行动联合声明，是中国民间组织作为社会第三部门，首次以一个整体的形式，表达对危机事件的关切，并采取切实行动，为国家分忧解难。所有参与联合声明的民间组织都表明了参与抗震救灾的行动方式，并公布了联系办法，以便受地震影响需要帮助的人士及时找到相关民间组织，获得帮助，社会公众也可通过这些组织奉献爱心。
    国内外经验表明，灾害发生后大型的公募基金会在迅速反应、社会动员、善款的专业化管理等方面可以起到重要的作用，成为政府救灾工作的有力补充，而其他专业化较强的操作型民间公益组织同样可以在各自的专业领域尤其是灾后重建工作中发挥不可替代的作用。日本、台湾的大地震之后各种类型的公益组织自发的为当地的民众提供心理咨询、志愿陪护、助孤助残、健康教育等专业服务。这类服务因为专业性较强，持续时间较长，效果并非立竿见影而容易被忽视，而事实证明，这些工作往往可以起到为政府大规模的紧急救助和灾后建设拾遗补缺、有力配合的显著功效。
    联合声明发表后，许多民间公益组织的活动如火如荼开展，北京关爱家庭中心开展了“我们就是你的家人——地震灾区丧失家人者苦难分担和专家心理支持”；东莞横沥镇隔坑村社区服务中心紧急开通流动儿童日托服务中心，帮助赶回灾区的民工照看子女，使他们能够安心回家救灾。北京农家女文化发展中心、陕西省妇女理论婚姻家庭研究会、北京大学法学院妇女法律研究与服务中心、北京红枫妇女心理咨询中心、河南社区教育研究中心、云南西双版纳妇女儿童法律健康咨询等组织也在策划联合向灾区派遣志愿者，开展救灾、心理辅导等志愿者服务。
    然而，资金缺乏极大地限制了专业型公益民间组织发挥更大的作用。“支持民间公益”是南都公益基金会的宗旨，在此关键时刻，南都公益基金会迅速宣布承担为参与救灾和灾后重建的民间公益组织提供资金支持的责任。由南都公益基金会长期资助的公益孵化器（NPI）也将利用其成都办公室和北京、上海的网络资源具体介入项目的征集、筛选、评估，以及公益组织在四川的联络与协调工作中来。
    目前，南都公益基金会初步拟定的资助领域包括救援、医疗救助、心理咨询辅导等志愿者服务，以及灾后急需的社会工作、教育、环保、助残、助孤、养老以及家庭重建、社区重建、心理重建研究、咨询等公益项目，具体细则会迅速出台。