2008年2月29日，南都公益基金会第一届理事会第三次会议在京举行。
出席本次会议的理事会成员包括有周庆治、徐永光、赵亦斓、何伟、林旦、王海光、康晓光、杨岳（委托安宁参加）、程玉（增补）九位理事以及监事陆建桥；黄传会、杨晓光两位理事因故未能出席。国务院法制办政法处处长朱卫国、中维会计师事务所所长易维佳、NPP执行董事兼董事长陈宇廷、君合律师事务所合伙人肖微、公益组织孵化器（NPI）主任吕朝、新华社评论室鹿永建等六人列席。
会议召开前，理事会一行赴朝阳第一新公民学校、大兴行知新公民学校、朝阳京华希望学校、大兴新苑学校、百年农民工子弟职业学校进行了考察和教师座谈。
理事会议增补程玉为理事，并审议通过了《关于修改<南都公益基金会章程>的说明》、2007年工作和2008年计划、2008年度预算及说明、 2007年投资管理情况及2008年重大投资活动计划报告以及基金会财务管理制度；听取了基金会年度财务审计报告、新公民学校项目开发工作报告、关于百年新公民职业学校合作计划及筹建两所新公民学校的说明、公益组织孵化器合作项目报告、NPP公益创投基金合作项目报告。
确定2008年机构发展方向
副理事长兼秘书长徐永光就2007年工作与2008年计划向理事会进行报告，肯定2007年5月11日以来的开局工作为未来发展奠定了良好基础，并指出要坚定不移地把打造城市新公民的目标进行到底，坚定不移地走中国非公募基金会的标准化道路，充分发挥理事会作为最高权力机构的作用，率先突破中国NGO的治理困境。
报告指出，新公民学校的建设和发展是基金会今年和未来长期的工作重点和难点，今后拟加强新公民学校发展中心的力量，大力推进新公民学校项目。会议审议通过，刘洲鸿任秘书长助理，并兼任新公民学校发展中心总干事；今后发展中心的工作主要是加强拟建学校的前期评估、校董会公共治理制度的建立以及学校的软件建设。新公民学校投资决策事项，由南都基金会理事会直接审议决定。
报告认为，基金会事业能否发展壮大，关键在于能否有效地整合各种社会资源。为此机构将加强资源动员工作，探索建立“新公民之友”志愿者队伍；重视与非公募基金会的联系与合作，共同促进行业及中国第三部门的健康发展；加强与政府的合作与沟通，重视向业务主管部门的重大事项报告，争取政府的理解和支持，争取宽松的发展环境并促进社会的和谐发展；同时继续加强政策倡导，推动基金会所得税政策问题的突破；进行民办义务教育政府补助政策和中央“两为主”政策落实情况的研讨和推动。
调整新公民学校发展中心工作思路，着力软件与品牌建设
新公民学校发展中心理事长程玉在会上就新公民学校项目作了总结与工作方向调整说明。
报告认为新公民学校“高软件、中硬件、低学费”的承诺尚未实现，在“高软件”领域工作滞后，建议南都种子基金向软件方面（旨在提升教育质量的资金投入，如：教师聘用、薪金/奖励、教师培训、教学软件、等等）倾斜，控制硬件投入比例。
报告建议，转换新公民学校发展中心的工作角色定位，从现有的直接担任举办人、控制校董会、直接派出财务的直营模式，转变为品牌管理经营模式以及加盟连锁的发展模式，制定新公民学校筹建和挂牌标准，面向社会招标选拔合格的举办人，实行举办人负责制，中心向学校输出理念、标准、资金和资源，提供服务，并进行评估和监督。
报告认为，只有当建立品牌、宣传品牌、引进资源进入正向良性循环的时候，新公民学校的发展才有可能进入成长期。
周庆治名誉会长在听完报告后表示，机构在将已有两所新公民学校做好做精的基础之上，将愿意大力投入新公民学校品牌建设的合作开发研究工作。
何伟理事长则表示，新公民学校发展中心在保证非营利性与公开性的前提下，可以对学校的控制采取更加开放的姿态。
赵亦斓理事、林旦理事以及王海光理事对报告中把软件支持提高到更重要位置的方向表示一致认同。赵亦斓充分肯定朝阳第一新公民学校通过人力投入、教学方法等软件建设方面的努力，使孩子们呈现出的崭新面貌，要求机构着力于软件，做孩子、家长和老师真正需要的东西。王海光理事提出，应耐心通过合理周期的共同努力，帮助新公民学校主办者获得资源，让各界资源变成营养，使教育产生真正好的成果；可以在硬件上保持适当的短缺和贫困，但必须在师资上下功夫，引进和培养最好的老师。
会议听取了百年新公民职业学校合作计划，南都基金会今年拟安排360万元，用于与百年农民工子弟职业学校合作，资助改建、新建新公民职业学校各1所，并建立百年新公民学校教师培训中心——该中心将同时承担今后百年新公民学校的建设和品牌管理。
基金会今年还将安排资金资助筹建4 所新公民学校及对已建新公民学校继续提供资助。理事会要求在新公民学校筹建对象的选择上需慎重，应加强前期考察评估工作，扩大选择范围，在已有申请意向的学校及举办者中进行更深入的调查评估，从中筛选出最优秀的新公民学校举办者进行合作。
做NGO标竿，推动公益产业建设
名誉会长周庆治在最后的总结讲话中，要求机构以一流NGO的标准来要求自己，走专业化道路，学习国外先进NGO的管理理念、管理方法，善于总结经验，把南都公益基金会做成中国真正的NGO标竿。
周庆治并希望基金会在推动中国整个公益产业的建设上发挥更大作用，以行业联盟、论坛等方式，促进NGO之间的项目合作与能力建设，支持民间公益，催生中国公民社会。
会议镜头之一：名誉会长周庆治（中左）、理事长何伟（中右）及各理事、监事等在会议中。
会议镜头之二：与会理事、监事、嘉宾认真倾听徐永光秘书长做2007年工作情况及2008年工作计划汇报。
会议镜头之三：理事、监事们审议某项议题。
会议镜头之四：名誉会长周庆治先生阐述意见。
会议镜头之五：何伟理事长主持会议。
会议镜头之六：徐永光秘书长阐述意见。
会议镜头之七：王海光理事阐述意见。
会议镜头之八：林旦理事阐述意见。
会议镜头之九：赵亦斓理事在会上。
会议镜头之十：陆建桥监事（中）、杨岳理事委托的参会代表安宁先生（右）倾听康晓光理事（左）阐述自己的意见。
会议镜头十一：杨岳理事委托的代表安宁先生仔细阅读审计报告。
会议镜头十二：陆建桥监事阐述意见。
会议镜头十三：新增选理事、新公民学校发展中心理事长程玉向理事们汇报中心工作情况。
会议镜头十四：上海浦东非营利组织发展中心主任、南都基金会资助项目“公益组织孵化器”负责人吕朝汇报项目运转情况。
会议镜头十五：中维会计师事务所所长易维佳女士在会上宣读《南都公益基金会2007年度审计报告》
会议镜头十六：会议邀请列席嘉宾、国务院法制办政法司处长朱卫国先生认真倾听情况介绍。
会议镜头十七：周庆治名誉会长（右）与列席代表、君合律师事务所合伙人肖微律师会议间隙交流。
会议镜头十八：会议间隙，徐永光秘书长（左）、朱卫国处长（中）、陆建桥监事交流。
